中疾控团队披露病毒发现过程 更多问题亟待求解!(图)

澎湃新闻/新京报 0

原标题:中疾控主任高福团队披露病毒发现过程,更多问题亟待求解

  随着新型冠状病毒进一步扩散,中国和世界各地的科学家们正齐心协力集结起来对病毒展开攻坚研究,开辟出医院以外对抗病毒的“第二战场”。

  1月24日,国家病原微生物资源库发布了由中国疾病预防控制中心成功分离的我国第一株新型冠状病毒电镜照片。北京时间25日凌晨,权威医学杂志《新英格兰医学杂志》发表了由中国疾控中心主任高福领衔的相关研究论文,披露了中国科学家发现并分离出新型冠状病毒(2019-nCov)的全过程。

  高福团队通过对早期发现的三名新型冠状病毒肺炎患者的样本进行全基因组测序,发现了一种从未见过的乙型冠状病毒属(betacoronavirus)病毒。该病毒从感染者气道上皮细胞中分离出,随后将其命名为2019-nCoV,这种病毒归属于Sarbe病毒亚属,正冠状病毒亚科,但形成了另外一簇的进化分枝。2019-nCoV与MERS-CoV和SARS-CoV都不同,它成为可以感染人类的冠状病毒科中的第七个成员。

  据《新英格兰医学杂志》中文版《NEJM医学前沿》25日的报道,高福团队在论文中披露,2019年12月末,几家当地卫生机构报告了一组不明原因的肺炎患者,这些患者在流行病学上与武汉的一家海鲜和湿畜批发市场有关。12月31日,中国疾病预防控制中心派出快速应急小组会同湖北省和武汉市卫生机构进行了流行病学和病原学调查。

  据研究报告,2019年12月27日,出现严重肺炎症状的3名成年患者被收入武汉一家医院。 患者1为49岁女性;患者2为61岁男性;患者3为32岁男性。研究团队收集了患者1和患者2的病史: 患者1没有潜在的慢性基础病史,但从2019年12月23日出现发热(体温37-38°C)、咳嗽及胸部不适症状。在临床症状出现后4天,咳嗽和肺部不适症状加重,但发热症状缓解,基于CT扫描的结果做了肺炎诊断。此患者的职业为海鲜市场的零售商贩。

  患者2初始症状从2019年12月20日开始,出现了发热和咳嗽。在起病后7天出现呼吸困难且后续2天进行性加重(胸片资料见图1),在此期间进行了机械通气。该患者曾经常出入海鲜市场采购。患者1和患者3在经过治疗后于2020年1月16日出院,但患者2在2020年1月9日死亡,没有采集到患者的组织标本。 


胸片

  高福团队称,2019年12月30日,从武汉金银潭医院采集了这3位患者的肺泡灌洗液。后从这3位患者体内都分离到了新型冠状病毒。论文称,尽管2019-nCov与蝙蝠体内分离到的乙型冠状病毒相似,但是与SARS冠状病毒和MERS冠状病毒有不同。上述3份来自武汉的2019新型冠状病毒与2份来自蝙蝠体内的SARS样病毒株形成了Sarbe 冠状病毒亚属B谱系中一个新的分枝;来自人体的SARS冠状病毒则与中国西南部蝙蝠体内分离到SARS样冠状病毒共同形成了Sarbe冠状病毒亚属的另外一个分枝。

  《NEJM医学前沿》同期发表的一篇社论中指出,继2002年暴发的严重急性呼吸综合征冠状病毒(SARS-CoV)和2012年暴发的中东呼吸综合征冠状病毒(MERS-CoV)之后,2019-nCoV是过去20年间在人类中出现的第3种致病冠状病毒。

  来自中国、泰国、韩国和日本的最新信息表明,与SARS和MERS相比,与2019-nCoV相关的疾病似乎相对较轻,2019-nCoV的致病性似乎比MERS-CoV和SARS-CoV弱。然而,这也导致了一个重要问题,即对遏制新病毒、防止其大规模传播会带来怎样的影响?

  社论指出,高效率的人传人是这一新病毒发生大规模传播的必要条件。然而,如果病毒感染不会引起严重疾病,感染者很可能不会就医。相反,他们可能会去工作和旅行,从而可能将病毒传播给接触者,甚至可能发生国际传播。如果许多感染者并无症状或仅有轻度症状(假设这些人能够传播病毒),那么确定传播链和追踪后续接触者将变得复杂得多。

  社论还表示,目前尚不知晓在病毒人际传播能力的整个范围内,2019-nCoV新病毒落在何处。但基本上可以认定,如果该病毒可高效传播,则其相对于SARS而言看似较低的致病性可能反而会导致大规模传播。这样,在个体层面构成较低健康威胁的病毒可在人群层面构成较高风险,有可能造成全球公共卫生系统的破坏和经济损失。

  另一位专家艾奥瓦大学的Stanley Perlman在杂志配发的评论中指出,关于这种新病毒感染,仍然有很多信息需要了解。最重要的是,需要确定人际传播的程度和临床疾病的各种表现,获得尽可能多的时间和地理上无关的临床分离株,以评估病毒突变的程度,并评估这些突变是否表明对人类宿主的适应性。此外,还应当尽快确定该病毒的人畜共患病病原体来源。

北大课题组:新型冠状病毒中间宿主或为水貂

新型冠状病毒可能具有与SARS病毒类似的感染力。

  新京报快讯(记者 许雯)新型冠状病毒的传染源至今未明。北京大学工学院生物医学工程系教授朱怀球团队1月24日发表的研究文章提示,蝙蝠和水貂可能是新型冠状病毒的两个潜在宿主,其中水貂可能为中间宿主。

  上述研究文章题为“深度学习算法预测新型冠状病毒的宿主和感染性”,发表于bioRxiv预印版平台,研究使用的是基于深度学习算法开发的VHP(病毒宿主预测)方法,用以预测新型冠状病毒潜在宿主。

  研究提示,与感染其他脊椎动物的冠状病毒相比,蝙蝠SARS样冠状病毒与新型冠状病毒具有更相似的感染模式。此外,通过比较所有宿主在脊椎动物上的病毒传染模式,发现水貂病毒的传染性模式更接近新型冠状病毒。

  这说明,蝙蝠和水貂可能是新型冠状病毒的两个潜在宿主。

  记者注意到,1月23日,中国科学院武汉病毒研究所研究员石正丽团队在bioRxiv预印版平台上发表文章“一种新型冠状病毒的发现及其可能的蝙蝠起源”。该研究表明,新型冠状病毒的自然宿主最有可能是蝙蝠,它与云南菊头蝠中存在的RaTG13冠状病毒一致性高达96%。

  病毒感染力方面,朱怀球团队研究表明,新型冠状病毒的6个基因组都极有可能感染人类。预测结果提示,新型冠状病毒具有与严重急性呼吸综合征冠状病毒(SARS-CoV)、蝙蝠SARS样冠状病毒(Bat SARS-like CoV)和中东呼吸综合征冠状病毒(MERS-CoV)类似的感染人类的强大潜力。

  [对话]

  课题组成员、浙江大学医学院第一医院、传染病诊治国家重点实验室副主任肖永红

  “新型冠状病毒与SARS病毒相似度很高”

  新京报:研究有哪些主要发现?

  肖永红:新型冠状病毒肺炎暴发以来,病毒的传染源一直没有找到。我们利用深度学习算法,分析了现有数据,包括新型冠状病毒及其他冠状病毒的基因序列,以及GenBank(基因数据库)中所有可用的脊椎动物病毒数据等。

  研究发现,新型冠状病毒与其他冠状病毒有相似的传染过程。蝙蝠身上有多种冠状病毒,这些冠状病毒可能先传染至哺乳动物,再传染到人。比如MERS病毒,中间宿主就是骆驼。

  对于新型冠状病毒来说,研究预测,蝙蝠是它的最主要来源,中间宿主可能是水貂。

  新京报:研究主要基于日前公布的新型冠状病毒全基因序列吗?

  肖永红:是的。对科学研究来说,病毒全基因序列非常重要。新型冠状病毒和相似病毒的进化分析,新型冠状病毒的检测方法,都基于全基因序列。另外,病毒发病机制研究、新型冠状病毒治疗药物及疫苗的研发,也基于全基因序列。

  新京报:从全基因序列看,新型冠状病毒与SARS病毒有什么关联?

  肖永红:我认为它和SARS病毒的类似度很高。首先,新型冠状病毒与SARS病毒同属于冠状病毒的β属,而且两种病毒的基因组序列80%相同,同源性很高。其次,从现有研究看,两种病毒入侵人体细胞的主要受体都是ACE2。第三,新型冠状病毒感染的肺炎发病时间也和SARS相似。

  两者不是完全相同的病毒,但关联性很高。

  新京报:昨天中国疾控中心首次公布成功分离的我国第一株病毒毒种信息及其电镜照片,这意味着什么?

  肖永红:全基因序列是拿到了病毒的信息,中国疾控中心在实验室中把病毒培养出来了,这对于研究病毒致病机制、药物研发都非常有帮助,奠定了非常好的基础。通俗地说,全基因组序列找到了“贼”的证据,现在是把“贼”抓住了。 阅读原文

文章来源: 留园 查看原文
https://www.6parknews.com/newspark/view.php?app=news&act=view&nid=397808
分享文章:
还没有评论
登录后发表评论
返回 到顶部